Der Verein zur Förderung des H2O-Museum wurde am 26.09.2007 in Berlin gegründet und ist beim Finanzamt für Körperschaften I als gemeinnützig im Sinne der §§51. AO eingestuft. Im Verein engagieren sich Menschen, die vom Element Wasser fasziniert sind. Ziel des Vereins ist es, dieses Thema in die breite Öffentlichkeit zu bringen. In Vorbereitung auf das zu gründende Wassermuseum geschieht dies über Ausstellungen, Veranstaltungen und sonstige Aktivitäten.
Das Gründungsteam arbeitet seit Anfang 2006 zusammen und trifft sich regelmäßig. Die Initiative ging von Dr. Michael Hofmann und Isabel da Silva Matos aus, die seit über 10 Jahren Exponate und Literatur zum Thema Wasser sammeln. Im Jahr 2002 gründete Dr. Michael Hofmann gemeinsam mit Horst Hinder das Büro „Wissenschaft+Graphik“, mit dem Ziel, wissenschaftliche Inhalte in neuen Formen zu präsentieren. Bereits 2006/2007 hat sich das Gründungsteam mit dem Vorhaben H2O-Museum am Businessplan Wettbewerb Berlin–Brandenburg beteiligt und belegte unter 240 Teilnehmern in der Gesamtwertung Platz sechs.
Von Anfang an hat der Verein zur Förderung des H2O-Museum eng mit Grafikern, bildenden Künstlern, Ausstellungsmachern, Museums- und Medienpädagogen zusammengearbeitet.